Dans une région hostile du far west nommée Gun Frontier, un ancien pirate dénommé Harlock (Aka Albator) et son meilleur ami Tochiro le samourai errant, rencontrent une mystérieuse femme, Sinonura.  Il voyagent ensemble à la recherche d'un clan d'immigrants japonais, victimes d'un massacre. Au cours de leur périple, il défient de nombreux dangers et bandits en tout genre.